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多年以前，从福利机构逃出的鹰野，在一个破旧的电话亭捡到十元硬币，拨通了高野一二三的电话，这一举改变了她的人生。
高野热衷于研究雏见泽症候群，军方担心高野一二三的研究继续深入将挖掘出细菌武器的幕后真相，进行了干涉并放逐了他。
看着爷爷心爱的研究陷入绝望的鹰野发誓，总有一天要以自己坚强的意志力左右命运，让爷爷成为神。
“绝对的意志造成绝对的命运！”
她这样认为，在雏见泽的神社投下十元硬币。
“只有当时的那十元硬币我是要感谢你的！”
但硬币被反弹了回来，羽入出现在她面前，说自己终于明白了。
“原来无论如何都无法逃开的命运是源于你那过于强烈的意志，我们不会输的，我们的意志是不会输给你的，用比你更强烈的意志来改变这个命运！”
“对不起，对不起……”
羽入回忆着自己旁观的一切，不停地道歉。
大坝战争的时候，满足于政府抚恤金的北条家与村人发生争执冲突，她只能无力地看着，什么都做不了。
“对不起……对不起……”
沙都子被欺负，她也只能看着而已。
“都是因为我这么无力……对不起，对不起……”
入江机关秘密进行遗体脑部解剖，却并没能得到病原菌，原因很可能是这种寄生虫会与宿主同时死去，为此，鹰野想到了活体解剖，尽管入江强烈反对，她仍委派小此木暗中行动，同时勾引拉拢富竹
接下来，大坝工程监督碰巧发病了，支持派的五人不得不自卫扑杀之，造成分尸案。
受到这种刺激的犯人之一进入了LV5状态。
鹰野故意让入江目睹他是杀人犯的事实，并且从富竹处得到他前科的证据，以他是个死不足惜的社会渣滓为理由，说服善良的入江对他进行解剖，入江迫于压力不得不屈服……一切都在鹰野的掌握之中展开……第一年作祟。
也就是这次病原体入手，入江初步研究出了代号为C103的治疗药——治疗药C120等的初始版本。
将监督当作父亲一样敬爱的大石开始他的调查，却错误地把目标定在圆崎家，因为圆崎婆婆说过要惩罚外来者和叛徒的话，开始了他与圆崎家漫长的恩怨
不断受到养父虐待的沙都子，身心受创，LV5发病，父母死后她又住进了诊所，鹰野预谋解剖沙都子。
“科学是不得不与时代的伦理和价值观进行战斗来取得进步的，不管双手要沾染上什么样的鲜血……”
但入江医生坚持作为一名医生对生命的尊重，对古手神社神主夫妇说出了真相。
梨花愿意协助针对女王感染者的研究，希望以此拯救村民。在梨花的恳求以及入江良心的谴责之下，机关最终决定在沙都子身上试用C103并获得了不错的效果。
鹰野接着打算解剖梨花，通过研究得知，女王感染者死亡48小时内全员将发病至LV5，她上报军部，军部开始策划到时候伪装自然灾害灭村的行动……鹰野看着那些权威如此重视这份过去被他们践踏的研究，获得了极大的满足。
大石找到入江谈论起北条夫妇的死很可能不是意外事故，而是杀人事件，当时沙都子声称在车里睡觉，醒来就立刻叫人说父母掉下了山崖，但是从停车处是无法看到出事地点的。她明显在说谎，这引起了大石的怀疑。入江也知道，LV5发病的沙都子，很可能是在重度疑心暗鬼过剩危机意识的驱使下，幻觉父母要杀她而将他们推落悬崖。
“对她来说这只是正当防卫，这不是意外事故，但也不是大石所说的谋杀，只是一出可怜的悲剧。”
梨花的父母因担心梨花的身体而表示不再合作，使研究工作出现了障碍。
鹰野想到了御社神作祟……绵流当天晚上，神主死于心脏病，妻子投沼自尽。
然而就正当研究进行的时候，鹰野三四最大的后盾小泉去世。
小泉的死导致上方派阀开始争斗，新生理事会对于入江机关提出了指示，放弃军事武器化的研究，研究方向为彻底根除症侯群研究治疗药并保持机密，三年内完成研究后解散。
鹰野对此表示不满，却和当年祖父的遭遇一样，遭到了他人的耻笑。
正在鹰野彷徨失意的时候，一个神秘的女人出现在她面前，对她说，她只是无辜地被卷入小泉身后的学阀继承斗争中罢了，如果想要向那些践踏了祖父心血的人们复仇的话，跟我合作吧。
第四年，一直为妹妹沙都子操心的北条悟史，逐渐陷入了LV5末期症状，就像礼奈一样，感觉到御社神的存在。
为了给沙都子买生日礼物，他开始拼命打工，退出了棒球部，退出前还向入江监督借走了棒球棍。入江虽然有所察觉他的异常，但后来还是迟了。绵流祭当天，北条玉枝被杀，第二天悟史联